Lech Kaczyński a fost președinte al NIK între 1992 și 1995. În timpul mandatului său, încrederea publicului în NIK a crescut de la 30% la 60%. În această perioadă, sub auspiciile NIK au fost organizate așa-numitele Simpozioane Falzmann (numele provine de la Michał Falzmann, auditorul Camerei, care a descoperit scandalul FOZZ). El a fost autorul Legii NIK din 1994, datorită căreia instituția a obținut independența și autonomia politică. Această lege a stabilit standarde de lucru ridicate pentru auditorii NIK.

La preluarea funcției, Lech Kaczyński a declarat că structura NIK era depășită, că informațiile erau deficitare. Noile persoane ar trebui să fie competente și să nu fie legate de grupări politice.

În 1994, la inițiativa lui Lech Kaczyński, a intrat în vigoare o nouă lege privind Camera Supremă de Control, datorită căreia instituția a dobândit independență și autonomie politică. Această lege a stabilit standarde de lucru ridicate pentru auditorii NIK.

Un succes al NIK în timpul președinției lui Lech Kaczyński a fost extinderea investigațiilor sale în domenii care până atunci nu fuseseră practic controlate, cum ar fi armata, poliția și poliția de frontieră. Între 1992 și 1994, ca urmare a auditurilor NIK 7200 de miliarde PLN recuperate din diverse titluriiar în aceeași perioadă, cheltuielile bugetare pentru NIK s-au ridicat la 1 200 de miliarde PLN (acestea sunt sumele înainte de denominare). NIK, în timpul președinției lui Lech Kaczyński, a controlat, printre altele, și scandalul privatizării Bank Śląski.